Het Ijtihad Center organiseert zijn onderzoeksprojecten, intellectuele activiteiten en evenementen, waaronder seminars, bijeenkomsten en lezingen, in zes onderzoekseenheden, namelijk:

• 1. Eenheid Interreligieuze Dialoog

• 2. Eenheid Oriëntalistische Studies van de Islam

• 3. Eenheid Juridische Kwesties in het Westen

• 4. Eenheid Migratie, Maatschappij en Religiewetenschappen

• 5. Eenheid Westerse Media en het Beeld van de Islam

• 6. Eenheid Islamitisch Onderwijs en Gezinswetenschappen

6 onderzoekseenheden